Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3Q9BXJ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3Q9BXJ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms