Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf50Q9BV19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms