Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms