Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SGIP1Q9BQI5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms