Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms