Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFKQ969G6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms