Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms