Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms