Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms