Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms