Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APTXQ7Z2E3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms