Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms