Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms