Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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