Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms