Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms