Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms