Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMP3Q1A5X7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMP3Q1A5X7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms