Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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