Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNHIT3Q15649 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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