Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A1Q14973 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A1Q14973 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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