Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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