Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB1Q14722 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNAB1Q14722 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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