Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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