Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP6Q0PNE2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELP6Q0PNE2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP6Q0PNE2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP6Q0PNE2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms