Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms