Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM3Q01628 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms