Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms