Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK6Q00534 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms