Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms