Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP1P78357 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP1P78357 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP1P78357 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP1P78357 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP1P78357 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms