Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX10P56693 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX10P56693 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX10P56693 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX10P56693 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX10P56693 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX10P56693 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX10P56693 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms