Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 GOLGA8A-205ENST00000569781 653 ntTSL 543.05■■■■■ 4.483e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PIK3R1-203ENST00000517412 865 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PIK3R1-210ENST00000520675 395 ntTSL 54.21□□□□□ -1.749e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CD164-206ENST00000499860 2845 ntTSL 1 (best)2.64□□□□□ -1.998e-15■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CCDC91-219ENST00000544780 693 ntTSL 333.33■■■□□ 2.939e-10■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 219.93■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.627e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.037e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 HBS1L-210ENST00000527005 2224 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.739e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 414.05□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 58.39□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 NDUFA10-205ENST00000414580 562 ntTSL 417■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 540.37■■■■■ 4.052e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 337.23■■■■□ 3.552e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 412.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 59.88□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 48.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 56.82□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 GNA12-206ENST00000485329 562 ntTSL 416.98■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CD46-213ENST00000471987 572 ntTSL 36.17□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CD46-210ENST00000462968 473 ntTSL 34.8□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CD46-216ENST00000490278 747 ntTSL 24.71□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CD46-215ENST00000488596 872 ntTSL 33.91□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 CD46-219ENST00000636114 2098 ntTSL 53.51□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 235.43■■■■□ 3.263e-9■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 233.82■■■■□ 33e-9■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 521.3■■□□□ 13e-9■■■■■ 27.7
HNRNPMP52272 DICER1-207ENST00000529206 1286 ntTSL 534.38■■■■□ 3.092e-6■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 DICER1-209ENST00000531162 607 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-6■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 DICER1-208ENST00000529720 498 ntTSL 1 (best)4.46□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.984e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 STK32C-203ENST00000368620 830 ntTSL 337.35■■■■□ 3.574e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-206ENST00000463411 1015 ntTSL 235.33■■■■□ 3.254e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-205ENST00000430295 440 ntTSL 234.43■■■■□ 3.14e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-204ENST00000393546 671 ntTSL 329.58■■■□□ 2.334e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-209ENST00000503346 669 ntTSL 228.49■■■□□ 2.154e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 STK32C-202ENST00000368619 733 ntTSL 227.53■■■□□ 24e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.884e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-215ENST00000506161 759 ntTSL 326.82■■□□□ 1.884e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PI4KAP1-203ENST00000612500 1869 ntTSL 226.11■■□□□ 1.774e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-210ENST00000503827 451 ntTSL 526.06■■□□□ 1.764e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.514e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 PDLIM7-211ENST00000504318 597 ntTSL 322.42■■□□□ 1.184e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-201ENST00000413405 767 ntTSL 1 (best)22.18■■□□□ 1.144e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 GNA12-205ENST00000471281 1205 ntTSL 321.57■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.854e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 GNA12-208ENST00000496740 2450 ntTSL 220.13■□□□□ 0.814e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 CABIN1-210ENST00000484593 561 ntTSL 317.03■□□□□ 0.322e-15■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 415.38■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 GNA12-202ENST00000407653 3785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 04e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-206ENST00000438202 652 ntTSL 214.48□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 TAF2-201ENST00000378164 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 GNA12-207ENST00000491117 3375 ntTSL 313.59□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-203ENST00000423223 507 ntTSL 210.18□□□□□ -0.784e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZNF148-210ENST00000497929 2381 ntTSL 55.2□□□□□ -1.584e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 33.52□□□□□ -1.854e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 519.57■□□□□ 0.728e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.89e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 34.44□□□□□ -1.79e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACSF3-214ENST00000543676 940 ntTSL 225.77■■□□□ 1.721e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 521.37■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACSF3-215ENST00000544543 883 ntTSL 521.09■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACSF3-216ENST00000562204 581 ntTSL 320.26■□□□□ 0.831e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACSF3-210ENST00000538340 434 ntTSL 517.18■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 244.53■■■■■ 4.728e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)40.14■■■■■ 4.028e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)38.96■■■■□ 3.838e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)33.89■■■■□ 3.028e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.028e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 312.46□□□□□ -0.418e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.58e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 211.93□□□□□ -0.58e-10■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.136e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.736e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)24.32■■□□□ 1.486e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 310□□□□□ -0.817e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACBD6-204ENST00000475338 964 ntTSL 516.27■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 ACBD6-205ENST00000496993 672 ntTSL 510.05□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 525.94■■□□□ 1.743e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 13e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 27.6
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 345 ms