Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB27AP51159 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB27AP51159 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms