Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPL28P46779 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPL28P46779 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms