Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms