Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR1P32246 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR1P32246 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR1P32246 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR1P32246 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR1P32246 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR1P32246 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR1P32246 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms