Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5F1P24539 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms