Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRMP19623 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRMP19623 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRMP19623 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRMP19623 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRMP19623 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRMP19623 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRMP19623 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRMP19623 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRMP19623 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms