Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXB8P17481 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB8P17481 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms