Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB1P16220 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB1P16220 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB1P16220 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB1P16220 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB1P16220 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms