Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF3P15923 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF3P15923 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF3P15923 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF3P15923 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF3P15923 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF3P15923 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF3P15923 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF3P15923 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms