Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT13P13646 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT13P13646 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT13P13646 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms