Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP2C9P11712 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP2C9P11712 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms