Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOP08100 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOP08100 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOP08100 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOP08100 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOP08100 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOP08100 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOP08100 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOP08100 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOP08100 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms