Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN3P07498 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN3P07498 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN3P07498 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN3P07498 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN3P07498 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN3P07498 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN3P07498 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN3P07498 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN3P07498 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN3P07498 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms