Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms