Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8B1O43520 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms