Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1I1O14576 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms