Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 RNPEP-212ENST00000492587 780 ntTSL 522.71■■□□□ 1.231e-30■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-211ENST00000495022 1374 ntTSL 222.57■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.182e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-203ENST00000435082 2023 ntTSL 222.11■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-216ENST00000556175 775 ntTSL 321.74■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-202ENST00000419386 829 ntTSL 321.65■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-202ENST00000416823 745 ntTSL 421.34■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-207ENST00000471125 612 ntTSL 321.27■■□□□ 12e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-211ENST00000495220 747 ntTSL 221.27■■□□□ 12e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-204ENST00000487341 550 ntTSL 421.22■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-204ENST00000461627 882 ntTSL 221.16■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-205ENST00000466367 866 ntTSL 1 (best)21■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MED9-204ENST00000585041 679 nt20.93■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-203ENST00000428622 569 ntTSL 420.8■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-219ENST00000534041 571 ntTSL 420.41■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-207ENST00000418034 1034 ntTSL 320.38■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-218ENST00000556262 1960 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-220ENST00000556548 2336 ntTSL 219.84■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-210ENST00000555225 769 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-201ENST00000376486 875 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AP002748.3-204ENST00000527274 944 ntTSL 218.9■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TUBA1A-206ENST00000550254 696 ntTSL 218.48■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 LINC00888-201ENST00000468380 1241 ntTSL 218.26■□□□□ 0.517e-16■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-209ENST00000483563 704 ntTSL 318.26■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-219ENST00000642002 549 nt18.25■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-203ENST00000431925 555 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-220ENST00000534798 568 ntTSL 417.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-211ENST00000641437 1911 nt17.69■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 LRRC8C-203ENST00000479252 2993 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-206ENST00000443896 3282 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-219ENST00000556523 735 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-208ENST00000479046 711 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-208ENST00000528219 1016 ntTSL 517.34■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 IQCH-AS1-205ENST00000561232 5748 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PSMB9-209ENST00000414474 439 ntTSL 516.57■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-210ENST00000529400 561 ntTSL 416.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-217ENST00000556249 556 ntTSL 316.38■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PHYH-205ENST00000463730 568 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-217ENST00000533598 872 ntTSL 316.14■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 316.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PSMB9-210ENST00000464863 2676 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-204ENST00000438229 1436 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SERPINF1-205ENST00000571360 478 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-45■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 LRRC8C-204ENST00000482063 504 ntTSL 315.9■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-210ENST00000598500 887 ntTSL 215.87■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-206ENST00000596757 579 ntTSL 515.65■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SERPINF1-206ENST00000571870 739 ntTSL 215.39■□□□□ 0.052e-45■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-205ENST00000525407 986 ntTSL 515.03■□□□□ -02e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-204ENST00000524430 561 ntTSL 414.98□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-45■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-212ENST00000641446 2820 nt14.76□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-211ENST00000599423 584 ntTSL 414.12□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TUBA1A-209ENST00000552924 628 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SYK-205ENST00000476708 467 ntTSL 213.84□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-213ENST00000530562 2339 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-205ENST00000594076 2193 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-204ENST00000392965 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SERPINF1-211ENST00000576406 795 ntTSL 313.19□□□□□ -0.32e-45■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-215ENST00000531849 5084 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 37.8
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